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被穆托抢走的核弹由于倒数器未被停止，只剩数十分钟后会引爆，为了阻止爆炸，福特和其他军人从上空空投到战场上，希望能将核弹给拆解，避免核弹爆炸的威力波及数万人的生命。哥斯拉此时正在城市内和穆托战斗。美军找到核弹，但因倒数器坏掉无法拆解，只好将核弹带往一公里外的港边。此时福特准备以油罐车内的石油将穆托卵全数烧尽。当雌穆托看到自己的婴孩被烧成灰烬时，愤怒地要将福特杀死。而哥斯拉趁着这段空隙射出了两发原子吐息重击雌穆托。飞来救援的雄穆托则被哥斯拉用巨尾甩击打死在大楼上，但却因撞击的力道过强导致大楼坍塌，使得哥斯拉自己被大楼埋没。
此时雌穆托打算摄取已被运到港口边的核弹内部辐射，并将反抗的军人们杀死。福特趁着雌穆托被其他军人吸引时，把放置核弹的船开往海上，但却再度被雌穆托给盯上。就在福特举起手枪打算做最后的抵抗时，雌穆托被再次出现的哥斯拉射入原子吐息。雌穆托在原子吐息的高温下被融断了脖子，哥斯拉将雌穆托的头部扔入海中，朝着天空发出胜利的吼叫，后缓缓倒下。随后失去意识的福特被救援队带离船上，并在朦胧中看到运出海外的核弹引爆。之后福特和他妻儿团聚，而本以为死去的哥斯拉却再度醒来，对着天空吼叫后，再次返回到大海。
古莫加，生活在南太平洋佐尔盖尔岛古莫加山谷中的巨大蜘蛛。跟同样住在这个岛上的卡玛奇拉斯不同，本来就是怪兽的大小。发现和命名是在太平洋战争后留在该岛继续调查的考古学家松宫正。根据松宫博士的笔记描述，这货在1955年以前就已经存在，直到1967年他女儿证实此事，知道古莫加的都只是松宫家的人。
有在土中沉睡的习惯，能从口中吐出有粘着力的强韧的丝。口中的毒针能直接刺向对手，也能发射出去。口吐的丝曾经一度封住哥斯拉的行动，但是抗火性很弱，打火机就能烧断。情绪高涨时眼睛会从蓝色变成红色。个性十分狂暴，会袭击其他怪兽以及人类。外观上就是一只蜘蛛。
在佐尔盖尔岛进行的气象试验失败、岛内怪兽横行时依旧在睡觉。当卡玛奇拉斯与迷你拉战斗时苏醒，之后在岛中徘徊袭击人类。利用丝线束缚迷你拉，在束缚卡玛奇拉斯后利用毒针将其击杀（毒针能击杀一般怪兽，昭和G一般怪兽就是这螳螂）。在准备杀死迷你拉时，哥斯拉出现，与古莫加交战。利用强韧的丝以及装死毒针偷袭，打爆了哥斯拉的右眼（被打倒后哥斯拉的右眼也恢复了）。虽然令哥斯拉苦战，但是由于迷你拉的掩护，被虐，最后在雪中被哥斯拉与迷你拉的热线点着。
黑多拉，从宇宙飞来的矿物生命体在吸收都市近海堆积的污泥等公害污染物后融合成长的怪兽。有着“看着像破抹布以及海坊主幽灵”的外观，红色的眼睛竖着张开。身体要是变得干燥了的话就会变得七零八落，若是补给水分的话碎片就会集合成蝌蚪状的生物。可以通过合体使身体变得更大。在成长之后生出可以在陆上行走的足，后来更是可以二足直立，在完成期时还得到了飞行能力和发射光线的能力。在飞行形态时拥有可以轻松搬运哥斯拉的怪力，使用污泥以及各种各样的能力使哥斯拉陷入苦战。
黑多拉经过的地方都会蔓延出硫酸雾，能使金属腐蚀，使人变成白骨。由于可以吸入污泥以及工厂的废气，所以可在短时间内改善环境，但那些污染物却会在其他地区扩散，这一点体现了对工业地带等牺牲地域谋求发展的行为的批判。
飞行与光线的原动力是依赖于体内的爆发，剧中矢野博士解释这是与恒星同样的原理，在后年的书籍中则是记载作“吸收了哥斯拉的核物质”。
在生活的海域中不断袭击轮船，成长到一定程度后又袭击了工业地区，在工业地区中与哥斯拉发生了交战。受到哥斯拉的热线攻击，一度撤退。再次出现时得到了飞行能力，对途经的周边都市事造成了巨大伤亡。在第二次与哥斯拉战斗时完全占据上风，腐蚀了哥斯拉的一只眼，令一只手腕也化为了白骨。在哥斯拉和人类的共同努力下通过电极板将其干燥化，彻底杀死。
美加洛，西托比亚海底王国的守护神。飞行时使用翅膀（战斗中间的飞行除外）。双手是像钻头一样的形状，可以左右合钻来使用。除了钻头是武器外，地下高速移动奇袭等方法也会使用。从口中可以喷射地热凝固汽油弹，从独角前端可以发射激光杀兽光线。
由于地上人类不断进行的地下核实验使西托比亚海底王国的北地区全灭，海底人把美加洛作为怪兽先驱者送到地面进行破坏，海底人还从伊吹吾郎抢了喷射积格，和美加洛一起进行破坏活动。
此后，与自我有了意识并自己巨大化的喷射积格战斗开始了，开始时美加洛稍稍形势不利，海底人却又把盖刚请了过来，让喷射积格陷入苦战。但是，哥斯拉的出现再次扭转了战局，最后，美加洛钻入地底逃跑，西托比亚海底王国下落不明。
泰坦巨水龙是一种生活在侏罗纪的恐龙，身长和体重都强于哥斯拉（身长60米，体重3万吨），长相比较像海马。
泰坦巨水龙本来以为已经灭绝，后来被一位博士在小笠原群岛发现。博士尝试控制泰坦龙，但是实验失败，还把女儿害死了，后来想侵略地球的外星人复活了博士的女儿，博士念着救女之恩和当年的发现被科学组织打压而产生的对人类的憎恨，当了一回汪精卫。泰坦巨水龙便在博士女儿的控制下和机械哥斯拉一起毁灭人类的城市。
泰坦巨水龙除了有长得比较像海马外，还能用蹼一样的尾巴扇出类似拉顿的狂风的技能。弱点是比较怕超音波，听到超音波后就会失控。
哥斯拉挺身而出保卫地球，结果被这俩虐的很惨。最后多亏人类破坏了外星人的基地，并用超声波干扰泰坦巨水龙，使泰坦巨水龙失控，同时机械哥斯拉也因为操作员（博士女儿）自尽而当机，才让哥斯拉拿下了最后的胜利。