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宇宙雷兽巴茨斯，是距离地球44光年外的m91恒星系的宇宙怪兽，被根源的破灭招来体通过虫洞传送到地球上。出于生物对未知环境的本能，巴茨斯变得凶暴狂躁，从犄角放射出巨大雷电来对东京市区进行大肆破坏。
巴茨斯一边破坏一边向其他市区移动，同时还放射出大量的妨碍电波干扰电子仪器，就连xIG战斗机用来攻击巴茨斯的导弹也因为诱导装置被干扰而无法命中，G·U·A·R·d的地面疏散工作也陷入困境。在改用手动操作飞弹后，巴茨斯一时**IG战斗机的攻击吸引了注意力，地面疏散工作也在千叶参谋的指挥下完成。巴茨斯在要用雷电攻击地面上撤离不及的千叶参谋时，高山我梦变身为盖亚·奥特曼登场，阻挡巴茨斯的闪电后和其作战。
一开始，巴茨斯和盖亚在格斗战中是呈现出互角的态势，后因为行动不及盖亚灵敏而渐落下风，但巴茨斯趁机用犄角雷电的猛攻压制了盖亚，大量消耗了盖亚的能源并将其打倒在地。后来，巴茨斯在接近盖亚时却反被抓住时机，盖亚突然站起并使出「量子流线」击中巴茨斯，在数秒的持续射击后，巴茨斯最终被炸成了碎片。
炼金之星在距离地球44光年外的m91恒星系上探测到了巴茨斯和戈布的生命体反应后，G·U·A·R·d推测此地便是破灭招来体的母星，于是部署了虫洞导弹作战，决定以人工虫洞把拥有爆星威力的终极导弹传送过去，消灭巴茨斯等破灭招来体。但在计划实施时，根源性破灭招来体也制造出虫洞，和G·U·A·R·d的人工虫洞对接，把巴茨斯的第二代个体、以及其同族的怪兽戈布传送到地球上。
巴茨斯在虫洞吸收了大量的次元能源，强化成为超巴茨斯，战斗力大幅提升。超巴茨斯和戈布强化成的超戈布一同摧毁了虫洞生成系统，还打算破坏虫洞导弹。盖亚V2现身阻止两大怪兽，但超巴茨斯战力强劲，加上与超戈布联手，二对一将盖亚V2逼入险境。关键时刻，藤宫博也变身为阿古茹·奥特曼（V2）登场，帮助盖亚对战两大宇宙怪兽。超巴茨斯先后和阿古茹V2以及盖亚至高型交战，但始终都被对方压制。最终，盖亚至高型和阿古茹V2联手施展出爆裂流线，将超巴茨斯和超戈布彻底消灭。
根源破灭招来体巨兽佐利姆，身体巨大，具体长度不得而知，是极高的智慧与强大战斗力的完美结合，招数为口中吐出的火焰。
佐利姆秘密控制了藤宫博也设计的光量子电脑——克里西斯，使其得出“消灭人类”的错误结论，最终导致两个奥特曼的对立。当它确定时机成熟之后，就开始了计划的最后一步。
他先通过虫洞使自己的力量可以传达至地球，导致星空图的扭曲，藤宫通过扭曲的星空图估算出了这个对手的恐怖力量，决定唤醒全部地球怪兽来与之对抗。只是这样做虽然可以保住地球，但地球怪兽的出现无疑会威胁到人类，以保护人类为使命的盖亚自然不会袖手旁观，于是矛盾上升至顶点，两个奥特曼的战斗不可避免，两股力量相互撞击，打开了更大的虫洞，这一切都被佐利姆看在眼里，不仅成功制造了自己到来的通道，而且使得两个奥特曼打得两败俱伤，可谓一箭双雕，而且他到来之后做的第一件事就是使克里西斯暴走，xIG防御体系登时陷入瘫痪。
佐利姆能喷出强力的巨大火焰。另外，它对来自外部的攻击有着极强的防御，是连拦截防卫队的战斗机的导弹和盖亚V2型的量子流线都无效的强敌。受到闪电队、猎鹰队、酷龙队向虫洞的一齐攻击后在踌躇之际盖亚首次升级为至高型从佐利姆嘴部飞入体内，在其内部释放光子流线将之打败。
金属生命体米莫斯，因为被根源破灭招来体侵入而**IG解除全部连接并且冻结的超级光子电脑克利西斯（危机号）释放的程序侵入了Geo·base基地的主电脑后，为了得到一个可以活动的身体，把F4实验室中保管的过去出现的金属生命体阿帕苔与阿尔吉洛斯的碎片组合而形成新的金属生命体，实力也是三个金属生命体中最强的（克利西斯在系统即将停机时最后发出的命令成为了独立的程序残存在了网络上，就像是亡灵一样）。
最初登场时以假盖亚·奥特曼的姿态出现，面对xIG队员的试探性攻击并不还手，表现出狡猾的一面。将闪电队大河原乘坐的Fighter SG战斗机捕获，高山我梦变身盖亚·奥特曼登场救下了大河原，在真正的盖亚和大河原的猛烈攻击下渐渐露出原形，最终变成了米莫斯。
米莫斯与盖亚展开了格斗战，其身手敏捷，利用全身金属突起物变为的飞镖连续攻击盖亚，又以叉状武器的金属片像十字架一样把盖亚禁锢在地面上，但在闪电队和酷龙队的猛攻下形势逆转。与此同时盖亚挣脱束缚从V2型升级为至高型完全压制了米莫斯，使用连续的投摔技将其重创，最终受到至高型光子流线的攻击被彻底消灭，同时寄宿在克利西斯中的根源破灭招来体也完全消失。
哥奇古蒙，一种形似昆虫的宇宙怪兽，为了繁育后代而在宇宙中四处飞行，在飞过月球背面后直朝地球冲来。在怪兽侵入地球时，xIG的空中基地捕捉到它的画面影像，因其外形很像蟑螂和蜘蛛的结合，因此被高山我梦命名为「哥奇古蒙」。
哥奇古蒙在海上飞行时，利用翅膀产生的音爆甩开了猎鹰队的追击，飞到K1都市地区。随后，哥奇古蒙以丝线粘液将一栋大楼筑成了巨大的虫茧，并将附近来不及逃脱的人类捕捉到茧内，打算将抓来的人类作为自己接下来要产下并孵化出的幼虫的饲料。xIG派海鸥队出动，用麻醉弹将哥奇古蒙放倒后，救出了四个被抓进茧中的人们，但哥奇古蒙突然醒来并袭击海鸥队，导致剩下的一人-佐佐木律子被遗留在茧里，没能救出。
哥奇古蒙在茧内产下100个虫卵，等待孵化，期间一直守护在巨茧附近。xIG分析出茧的结构有着很强的可燃性后，派出闪电队进行燃烧弹作战；同时，高山我梦变身为盖亚·奥特曼登场作战，但不久就被哥奇古蒙用丝线粘液封入茧里而暂时失去战斗力，闪电队的燃烧弹也被哥奇古蒙弹开。
盖亚变身为至高型破茧而出，以强大的格斗技压制了哥奇古蒙，闪电队的梶尾队长则趁机救出了佐佐木律子。在被盖亚至高型的投技重创后，哥奇古蒙已经失去了反抗能力，最终被盖亚的「光子流线」消灭，它的巨茧和虫卵也被闪电队彻底烧毁。