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太极系统的结构体系大概为倒金字塔型，其基本结构是一些基本模块。这些模块包含了一些简单的算法和功能。虽然简单，但是计算机所有功能的实现都是这些简单算法和功能的叠加，因此也是最基础的。这部分模块完全采用龙翔发明的八卦机器码写成，可以直接被计算机识别，可以直接操作硬件。这就是太极系统倒金字塔结构体系的最底层。也是最核心的部分。这部分代码的保密级为最高，目前来讲，只有龙翔才可以掌握。事实上其他人也掌握不了。因为世界上除了他以外目前根本没有能看懂全部由八卦符号组成的程序的人。
倒金字塔的第二层是功能模块，这部分模块目前也只有龙翔掌握，其保密级仅次于八卦机器码。这一部分实际上是一些可以将汉语程序语言转换为八卦机器码的程序。它们在系统中的地位相当于传统电脑中的汇编语言。这一部分程序包括了双向翻译程序和汉语程序编程软件。这种程序使用的程序语言是龙翔设计的以古代文言文的文法为基础，在电脑上显示为小篆字符的“仓颉”程序语言。龙翔本来还想采用甲骨文作为载体的，不过考虑到甲骨文还没有完全成熟，字形也不太固定，不利于应用，这才采用了成熟的字体：小篆。没有人知道他为什么这样做，不过除了保密的因素，大概也有一层恶搞的因素吧：嘿嘿，你们老外想偷我的源码？怎么样？看不懂了吧？我憋死你！这种语言就连国内的人都很少能够读懂，更别说那些看到方块字就头疼的老外了。国外很多想破解太极操作系统的超一流程序员都无一例外的栽倒在小篆加文言上。后来世界上杰出的程序员，号称能够破解所有程序的吉米在勉强读懂仓颉程序后（当然仅限于勉强读懂，要说破解根本就不行，因为在仓颉程序下面还有八卦机器码呢，这个就更加难懂了）曾对人苦笑道：“幸好他没有使用甲骨文，否则我恐怕根本就没有办法读懂。”不过龙翔的这种做法还有意想不到的收获：全中国掀起了学习古文和篆书的热潮。一个人如果不会说会写古文，不会认篆书，那就要被别人用白眼看待了——新时代的文盲。一股复古的浪潮也全面兴起，同时这也造成了中国传统的辉煌文明的回归，使得中国的古文明在现代科技的基础上获得了新生。以至于这一段时间后来被历史学家、文化学家成为中国的“文明复兴运动”与中世纪欧洲的“文艺复兴运动”齐名。当然这都是后话了。
倒金字塔的第三层就是汉语程序语言以及使用这种程序语言编制的应用程序。这种语言最简单易懂，因为所有的语法和语句都全部取材于现代汉语。可以说只要会汉语的人，稍加训练就可以自己编制基于太极操作系统的应用程序。当然，术业有专精，一般的人只能编制简单的小程序，要想编制大型的专门的应用程序还需要专业的程序员才可以。这种程序语言的名字被命名为“普通”程序语言，简称“普语。”也就是说，一个普通的用户都可以掌握的程序语言。后来这种程序语言全面公开后，在全国都引起了革命。可以说中国人接近计算机的所有语言、文化障碍都已经被排除了，相反，外国人要想接触计算机还有些语言文化障碍。毕竟在龙翔的帮助下，未来中国的计算机技术将比其他国家先进几十年乃至上百年，他们就是想不用中国的计算机也不行。这一层次的所有代码都完全公开。这种语言也是太极系统唯一的程序语言，也只有这种语言才能不需任何翻译就能被太极系统识别，其他的程序语言编出来的程序都必须被翻译才能被太极系统识别。当然，翻译程序本身也是一种用普语编制的程序。目前的翻译程序被命名为“万码通。”在太极1。0上面该程序的版本为v1。0，那么在太极2006上版本当然就是v2。0了。
龙翔目前仅仅写了太极系统基本功能的代码。要实现其他功能，暂时可以通过代码翻译器翻译其他操作系统如windows或者liunix或者unix上的应用程序。因此可以说太极1。0操作系统仅仅是一个原始版本。由于时间仓促，目前他还没有办法把所有的应用程序准备好。
代码翻译器的工作方式有两种，一种是即时翻译，另外一种就是永久翻译。即时翻译并不改变原程序的代码，只是在运行的时候进行即时翻译。永久翻译就是把原代码的程序改写为普语代码编译的程序。为了避免给竞争对手以侵犯版权的口实，这种永久翻译模式在默认状态下是被屏蔽了的。因为几乎所有的软件厂商都不愿意别人反编译他的程序，这样做会不可避免的泄漏原代码。同时他们也通过各种手段对原代码进行了加密。万码通的翻译实际上就是首先将软件反编译成汇编语言，然后再从汇编语言转换为普语。当然这样做难免会遇到一些兼容性问题，所以只有专业版本的太极操作系统才提供了这一功能。一个程序在太极操作系统中运行的时候，系统会首先扫描其标签，如果有标签标识者程序为普语编写的程序，否则就对之进行分析，看是应用于何种操作系统的程序，然后将之记录下来，标记在程序中。当程序运行的时候，系统就根据判断出来的操作系统类型进行相应的反应，从而将程序正常运行。这样一来，第一次运行一个程序花的时间要稍微就一点，因为系统需要判断其类型。不过这也仅仅是权宜之计，最好的方法是编写全面基于普语的应用软件，这也是以后工作的当务之急。
通过这样的设计，太极系统的效率比原本的混沌系统要高上几十倍。当然，太极系统也继承了混沌系统的自进化代码，对病毒拥有超强的防御能力。在以后专门开发的用于超级电脑的太极版本中甚至因此产生了初步的类人智能，并在盘古中诞生了人类历史上第一个电子生命。不过这都是零点公司已经发展到世界第一之后的事情了。
为了让系统得到最大规模的支持和使用，龙翔准备将中文编程语言公开，以便让广大爱好者自己编制基于系统的应用软件。而随后的仓颉语言和使用仓颉语言编写的太极系统源代码也会随后公开。从表面上讲，太极系统就是开放源代码系统了，不过由于语言的障碍，实际上只能叫做半开放源代码系统。
在开发系统的过程中，龙翔虽然脑域开发达到了相当高的水准，也感到十分吃力。再者，一个人的思路毕竟有限，只有广泛吸收大家的意见才能将系统做得尽善尽美。虽然目前的系统仅仅只是个原始版本，还没有自己的应用软件，但是自己的应用软件是发展所必需的，绝对不能马虎。原本研发部的结构类似于其他公司，但是龙翔认为这样还远远达不到自己的要求，因此他对研发部进行了调整。