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昊天经过巧语劝说，终于借得素色云界旗，便是想招使上界仙人下凡帮助轩辕消灭蚩尤之乱，插足人族之事。
却说天地初开时，诞生了一杆旗，名为五方旗，是防御中灵宝，先天有灵，妙用无穷。这五行旗成形时，却是化作五旗，皆为防御少有的灵宝。分别是中央戊己杏黄旗，东方青莲宝色旗，南方离地焰光旗，西方素色云界旗，北方玄元控水旗。那瑶池金母得素色云界旗，便得西方庚金气运，却是展旗就能聚仙，因此又名聚仙旗。黄清造的五行旗便是他们的代替品。
受王母之命，被聚仙旗招来的是九天玄女，算是女仙之首。
昊天帝道：“那蚩尤是大巫之身，你可将此剑带下，赠与人皇。”
九天玄女接过，应道：“是。”退出殿外，出了天宫，向地界而去。那玄女到了逐鹿之野，轩辕军中，见那人皇轩辕一脸英气，相貌不凡，不知怎的心中生出无边情愫来。那轩辕是土德之身，先天九阳之体；九天玄女却是六阴之体，两者自然是想吸引。他们自然而然号了起来。
昊天给轩辕的剑，也不是凡剑，乃是当年帝俊所炼的屠巫剑。采星辰之精炼成，锋利非凡。是日，轩辕和蚩尤再次战在一起。轩辕虽然修为不比蚩尤，但屠巫剑却是轻易就把蚩尤伤了。
蚩尤见大巫之躯竟然挡不住轩辕的剑刃，大怒不已，吼叫连连，却见那八十个铜头铁脑的怪物围上前来，蚩尤大叫道：“都天神煞，巫血分身，合体！”只见一阵血雾弥漫，将蚩尤和那八十个怪物笼罩其中。轩辕和玄女见血雾弥漫，赶紧退开，并命大军撤后。轩辕一方后撤，但蚩尤大军见没有了头领，正不知
所错，血雾一下扩展开来，将大军遮掩，顿时从中传出阵阵惨叫声。轩辕连忙命大军再次后退，不久，血雾之中没了惨叫之声，那血雾一下子向中心之处聚集。
原来是蚩尤以鲜血为引，施展巫族秘法，真正成铜头铁骨，屠巫剑也伤不得了。这时候，蚩尤狂叫连连，挥起化血神刀，杀得轩辕大军死伤无数。
这时，一道人唱诺而来：“鸿蒙之初有真仙，见过盘古来开天。洪荒亿载苦修道，玄仙不敢在我前。”
这道人好大的口气，竟称自己是混沌未开的得道真仙，还夸除去圣人，没有人再敢排在他前面。到这道人看是慢慢走来，但一眨眼就到了跟前，端是要得。近前一看，却是一个面型消瘦，穿一简朴青色道袍的年青道人。众人都不大相信他有什么大本事。
不过，轩辕在看到道人后，却是很欢喜，慌忙跪拜道：“弟子轩辕拜见老师。”
这正是黄清前来。黄清点点头：“起来吧！你现在为人皇，却是不能再拜我了。今次前来，我是要替你降伏蚩尤的。”
轩辕谢过大恩，对黄清恭敬有加，黄清也不理，便向蚩尤走去。
众人听到轩辕喊黄清老师，大吃一惊，转瞬也就明白眼前少年是何人了。鸿蒙道人是现在六位圣人的师弟，神通广大，降服一个小小的大巫，自然不在话下。当然这个“小小”是相对于黄清来说的。
众人但见黄清走到蚩尤身前，微微一笑。那蚩尤看见黄清走来，虽不知道黄清为何人，他却是感到面前的人如洪荒大地般，威压股股而来。巫族人皆是好勇斗狠之人，蚩尤也不管太多，拿着化血神刀心下一横，就劈打起来。那一刀威力竟劈得空间都碎裂，轩辕众人禁不住齐齐后退，脸色大变。黄清也不看到势，混沌珠祭起，两人就这样突然消失在众人面前，然后又突然出现，就像从来没消失过一样。
不过，蚩尤却是躺在地上动弹不了，而化血神刀落在一边。其实在那瞬间，蚩尤已被黄清用大法移到混沌珠里，黄清一指点在他身上，他便法力被封，再一指点在化血神刀上，刹那间，黄清防佛再次置身洪荒太古，见到十二个巫人不停吼叫，最后成一个拿着巨斧狂劈的大汉。黄清领悟着，十二都天神煞大阵，在脑中再次演练着。
黄清也不管众人，身形一闪径自而去，蚩尤留给他们善后。众人心中具是大惊，准圣已是如此存在，几近无敌，那传说中的圣人，不知厉害到什么程度。当时，也没人顾及黄清的离开，只在想办法破大巫之体，除去蚩尤。
东海蓬莱岛鸿蒙殿中，黄清坐在蒲团上，双眼紧闭，左手持鸿蒙钟，右手持开天斧，五行旗绕着周身神秘地旋转。顶上庆云涌现，现出三花，花上又有一灰蒙蒙的混沌珠悬浮。其实，黄清三魂七魄已合成一道人影出现在其身体内，那人影也是黄清。体内充满混沌之气，只见黄清用混沌之火不断炼化一拇指大小的鲜血，正是共工身陨后黄清所得到的盘古精血。
当黄清炼化盘古精血之后，整个人又转到混沌珠世界里，再次进行未成工作。黄清以身为鼎，用蚕丝玄铁炼一十二杆旗，布十二都天大阵，吸收精血。只是瞬间，那旗杆就吸收丝丝元灵而来，黄清感到无数信息涌向元神，，混沌之气也是越旋越快“轰”一声爆响，黄清终于聚出了盘古真身，但却是很弱小，还不大真实。
太极生两仪，两亿生四象，四象化八卦，其中又有三才，五行，六合，七星，还有之后的九宫，十绝等等，乃至于天地万物。道生一，一生二，二生三，三生万物。最初的道，便在这混沌之中。盘古开混沌，清者为天，浊者为地，再以自身演化万物。这便是道！
从合到分，从分再到合，便是大道，是为合道。
黄清在合道，鸿蒙钟、五方旗、开天斧在不停旋转、翻滚，到他最后合道时，这三件他成道之宝，便为更甚于接引十二品莲台、准提七宝妙树的法宝。它们是乾坤鼎所出，混沌珠所孕育，乃是先天灵宝。
合道，是一个漫长的时间，但黄清却可以预见了。此时，他成道已不可避免，即使圣人也不可能杀死他，只可以把他封印镇压，他的法力神通几可比拟圣人，欠缺的只是道行罢了。
黄清也没停止修炼，他沉浸在大道中，悟，不停地悟，他悟道的同时，也把道化进成道之器中，截天道而成灵宝。以自身为混沌，开天辟地，然后演化洪荒，造化万物，大道所在。
修行不知岁月，黄清悟道当中，神识感应又有一份功德加身，便知轩辕已辞去人皇之位，功德圆满，到火云宫修行去了。这却是由于黄清算出轩辕剑已经出世，此剑本就是那屠巫剑，在轩辕到太清天兜率宫拜访老君之时，被老子放到八卦炉中，加入人皇功德和轩辕九阳之血重新炼制而成。炉中出了两把剑，一把是圣道之剑轩辕剑，那轩辕剑长三尺，剑身两面，一面刻日月星辰，一面刻山川草木，剑柄两面，一书渔牧农耕，一面书圣人教化之篇章；另一把名为腾空，也为人教圣剑。轩辕退位，将皇位传给了颛顼，而那把腾空剑也成了颛顼的佩剑。
老君于此明白，以教化功德可演化后天圣器，不比先天灵宝差。便将此事告知元始，至于通天，关系不深，并没有说。
而黄清早已知道教化功德之重要，他收轩辕为徒，便有此打算，因此他得到的好处并不比老君少。他也不想浪费这份功德，是想等成圣以后，炼出一功德圣器。
又过了些年，盘古真身已凝聚完成，此时离封神时间仅一百年而已。