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在此之后，初泰二年末开始招募的那些预备军中年纪过十八的军士渐渐调到禁卫军中，成立新翼营开始参与对刘备和曹操的突袭战。
凉州的镇西、定西两军也时常出动，进入雍州夺县移民迁入西凉，说的好听点是鼓励百姓移居凉州，说的难听就是掳掠人口，刘备对此颇为震怒，几番令徐晃、杨奉反击，却毫无成效。
于是刘备计划的清剿曹操、控制中原的战役，因为刘协的针对性安排，变成了一场三家在中原的会战，刘备、刘协、曹操总计投入的兵力高达百万人，而淮阳的袁术、青州的臧霸也时常出兵，加上北方袁绍和刘备仍然保持开战状态，公孙瓒和刘虞正式在幽州对峙起来，刘协不停出兵清剿山越和扬州南境的盐匪，为了拖住刘备的主力进入中原，在长安和凉州之间，刘协的镇西军、定西军也和刘备的长安驻军保持长期焦灼状态的对峙。
曹操此时才想起戏志才之言，心中悔恨，急忙让陈矫在九里山和石崵山之间修筑长城，命名为九石长城，同时加强沛城城墙，将小城相县、萧县和细阳县城墙依大城进行建设，自兖州和豫州迁移百姓百万南下，使灵璧成为户过三十万的大城。
九石长城总长一百二十余里，曹操一面出兵对抗刘备，一面建城，钱粮颇为不足，以百姓无粮过冬为由向刘协借钱粮。
刘协知其正在修筑九石长城，询问戏志才，戏志才道：“若无此城，曹操定然守不住徐州！”
刘协便令人计算修筑所需钱财，得知须钱六千万钱，粮草两千八百万石，便让曹操用铁矿交换，待曹操同意后，复令张昭在三年内分六次拨付。
整个中原都因为曹操之父曹嵩而点燃了熊熊战火，整个大汉在黄巾起义和讨伐董卓之后，再次陷入了一场剧烈的震荡中。
这一次的诸侯大战，实力最强的刘协一心剿灭扬州的山越，在军力上不弱于刘协的刘备一心灭掉眼中钉曹操，所以两人尽力克制在双方之间爆发大规模的战役，以免影响自己预定的计划。
平定了山越之后，刘协就能够安心吞并交、益两州，进而才能有实力和北方刘备对决；灭掉曹操之后，刘备才能够尽得兖、徐两州，甚至可以染指豫青，一场注定的对决就像宿命一样摆在两人面前，他们彼此都在为那一天的到来而准备。
初泰四年秋，曹操再派满宠前往襄阳，希望刘协出兵洛阳，曹操给出的条件是让出徐州给刘协，为了防止刘备坐稳中原，治略台和统帅台对这个建议很赞同。
刘协却果断的否定掉，他与满宠说道：“天下有今日皆因曹操之故，岂能与之合作！我乃大汉楚王，怎能北攻皇帝之地！”
待满宠辞去，刘协对众臣道：“刘备善于用人，曹操亦善用人，然刘备长于坚忍，曹操长于攻伐。若刘备得势，其坚忍之长尽失，反之曹操得势，则楚地难有太平之日！况刘备虽有尽臣下才能之名，实则自身无能掌控局势，长此以往必受制于重臣，日久则必生变数，我还可静观其变而动。操之能十倍于刘备，一旦得势则如龙跃天，再难相制，今日机会难得，当乘机灭曹操！”
众臣皆服，赞刘协不愧为天纵奇才，私下底更知大业定矣！
在刘协心中，他深知曹操的能力远胜刘备，故在自己没有更多精力对付北方的时候，宁愿刘备坐稳北方，也不愿意看到曹操统治北方的局面。
在秋末休战之时，刘协前往长沙视察东小麦种植的情况，发现农户所种的粮种并不一致，有好有差之后，刘协马上让张昭成立粮种司，专门在各地抽选最好的良种，在官田试种之后再进行遴选，然后向楚地各地推广。
金陵城的建设中，江东的大族吴氏在治略台调拨五千万钱的基础上，组建了第一家符合刘协要求的东南商社，并且首先成为建设业中的第一位国商，刘协亲自从襄阳学府中抽调一部分擅长水利工程的学子前往东南商社，并将金陵城的八成以上工程包给商社，鼓励商社继续走下去。
刘协将士子按学识分成学子、学士、学者、博士、大贤五个等级，按课业分成经、商、律、医、文、艺六类，凡此六类皆可向各学府申报资格，和工匠分层一样，各层次士子都可享受治略台的津贴，同时硬性规定各商社雇佣的士子和工匠，应按治略台的规定支付相应薪酬。
由于商课在楚地实行多年，商人的地位也因为国商的存在而提高很多，大部分人都没有反对将精通商课的人定在士子之间，但对于医类第一次抬到这么高的地步，还是引发了大多数士子的反对。
刘协的第一个反应不是妥协，而是直接封张机为景安亭侯，以表其救治百姓之功，同时规定学子擅长医术的，优先招进襄阳学府。这一招让很多人措手不及，张机的功劳是明显的，他曾经救治汉灵帝，在南方发生瘟疫之时，屡次带领群医南下救治百姓，遏制住伤寒的扩散，可以说在他手中救活的百姓过万人，但能够封侯位还是让人吃惊，甚至是不可理解。
刘协通过这次封赏，巧妙的将人们的注意力移到医师的作用上，很大程度缓解了士子对医师的漠视和抵触，也提升了医师的地位，而自此之后，楚地乐于学医的士子也逐步增加。
仅仅这些还不够，刘协将襄阳学府扩大，将授课学士分开，在襄阳学府中设置襄阳经学院、襄阳商学院、襄阳律学院、襄阳医学院、襄阳文学院和襄阳艺学院，同时在新成立的江南学府按同样的制设进行改造，规定各院的首授官员必须有博士资格，职位为祭酒，而襄阳学府原祭酒管宁提升为总祭。
管宁对刘协连续的改制表示抵触，上书只愿担任襄阳经学院的祭酒，这倒把刘协难住了，只好请黄承彦出山担任总祭一职。
在这些事情处理完，刘协并没有停止步伐，他继续将马钧、白翳、郑浑这些人提了出来，成立襄阳工院，负责培养工匠，并且将原本属于军备台的划定工匠等级的权利放到襄阳工院手中，任白翳为祭酒。为了防止士子爆发抵触心理，刘协并没有将工院纳入襄阳学府，而是和襄阳军院一样，单独划规一个学府，同时将士子比较反感的农耕、水利、土木、炼丹等特殊课业划归襄阳工院。
在对待炼丹的问题上，刘协首先第一件事情就是把那些聚集在襄阳售卖灵丹妙葯的方士抓过来，狠狠地臭骂一顿，再故意安排张机等名医出面反驳这些方士，最后再出面让方士们按照自己的意思组建新的炼丹体系。
炼丹是很无聊的事情，刘协也不愿意把这些人纳入襄阳工院，可这毕竟是中国化学的始祖们，只能慢慢引导他们，日后能和罗马交流之后，再吸纳罗马的数学、物理、化学、建筑学等知识体系，对现在的体系进行更改。
此时刘协在对整个楚地学术调整上，尽力展开各方面平衡并重发展的策略，他知道直接引进后代的科学体系肯定是不现实的，只能想办法促进东西方尽早展开对话，吸纳西方科学体系的优点，对现在国内知识体系进行影响，日后再慢慢融合起来。
为了加速这个进程，在海楼船还没有完全试制成功之前，刘协让治略台和各大商社开始对海外进行探测，主要是制定地图，同时刘协也安排襄阳工院进行航海课题的讨论和研究，对于航海船只、工具进行新的设计和改造，自己也提供了很多思路，比如时钟的选择上，提出了钟摆制钟表计时和沙漏计时两种思路，让工院的人自行试制。
新粮种的培育工作，刘协也安排给工院负责，指导工院对大汉的植物、动物进行登记、研究，虽然不指望他们发现进化论，但是能够形成比较有体系的植物学和动物学也算是个好事，至少对现在的农业和畜牧业能够产生积极的影响。
刘协在这些事情上，思路是很明显的，他并不想将自己在后世学到的知识直接灌输下来，而是建立一个体系，建立一个惯例，让他们按着这样模式自己去发现。
当然，他并不打算搞普及教育，现在大汉还不需要很大量的知识分子，需要的是军队和商人，推动经济的发展确实需要百姓的力量，但让百姓掌握大量知识并不是给与他们力量，反而是让他们混乱，依照经济学的基本原理，发展生产力，适度推动上层建筑的更新才是王道。