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杨广巡边蒙羞，痛定思痛，决定先安内而后攘外，倾力剿匪。对站在剿匪一线的官员予以全力支持，另外，敦促河北河南慰抚大使杨义臣，赶赴河北。
李渊继续任山西河东慰抚大使，在陇东地区剿匪。
升任王世充为江都通守，在淮南地区剿匪。
提升郭绚为涿郡通守，南下河北进行剿匪。
杨广下令在淮南征募了数万新兵，交王世充指挥。这批淮南兵后来成为王世充的子弟兵，是他起家的资本。王世充在短期内将新兵训练完毕，以生力军进攻刘元进、朱燮领导的义军，连战皆捷，刘、朱先后战死，但仍有不少余部散在各处为盗。王世充找了个黄道吉日，集合有关人员，到通玄寺的佛像前焚香立誓，约定降者不杀。刘元进的余部听说后，纷纷投降，不到一个月，王世充就平定了吴郡。王世充成为杨广眼中新一代最杰出的将领。
616年（大业十二年）初，郭绚率领一万官兵，南下进入河北河间郡，要前往高鸡泊，讨伐高士达为首的起义军。
高士达自称东海公，是高鸡泊一带多股义军的公认首领，见郭绚领军前来讨伐，知道部将窦建德素有谋略，提升他为行军司马（总参谋长）。
窦建德决定采用诈降的方法克敌，亲自带领7000精兵，佯装脱离高士达投降了郭绚；高士达假装愤怒斩了几个罪犯，声称是杀了窦建德的亲朋同状。这都使郭绚信以为真。
窦建德看到取得了郭绚的信任，就表示自己愿作进攻起义军的先锋，为隋朝效力。郭绚毫不怀疑，带兵同窦建德一起向起义军进攻。当他们进至长河（今山东德州东）时，郭绚提出要与窦建德商量一下作战的具体计划，于是让部队停下来待命。就在部队休息待命，毫无准备的时候，窦建德的7000兵马突然向官军发起进攻。官军措手不及，阵脚大乱，郭绚慌乱中带领部队逃窜。窦建德率部猛追，在平原（今山东德州）将郭绚杀死，官军大败。
郭绚战死后，杨广急令右御卫大将军薛世雄接替郭绚，为涿郡通守，保境安民。
早在611年（五年前），张金称投靠高鸡泊的孙安祖，张金称性格残暴，与孙安祖一言不合，将其杀死，带领部分人马，杀出高鸡泊，进入河北清河县乡，进行抢劫。
612年，杨广命左翊卫将军段达率军前往清河镇压义军。起初，段达数次被义军打败，伤亡很多。后来，段达听从鄃县县令杨善会的建议发动反击，将起义军打败，张金称领残部溃逃。
613年，匪乱复盛，右侯卫将军冯孝慈领兵剿匪，被张金称击败身亡。
清河郡的鄃县县令杨善会，堪称大隋脊梁，与张金称等各路义军对战，不但力保县城不失，还能保护临县。数年之间积功升任清河郡通守。杨善会与张金称是一对苦手，数年之间对战数百场，起初杨善会胜多败少，但是活不下去的百姓增多，不断为张金称补充兵源，使得张金称总是能卷土重来，渐渐杨善会败多胜少，二人的亲信将领都被杀了不少，相互恨之入骨，也深知对方用兵之道。
616年（大业十二年）三月三日，张金称攻克平恩（今河北邱县），要以平恩城建立根基，一朝屠杀平民百姓男女一万多口。又克武安、巨鹿、清河等县。
当张金称回兵平恩时，河北河南慰抚大使杨义臣率领二万骁果军赶来进剿张金称。
张金称扎大营于平恩县城东北，与县城互为依托。杨义臣率兵抵临清之西，据永济渠为营，距张营四十里之遥。
杨义臣采取了杨善会的计策，勒兵不战的战术。张金称以为隋军胆怯，逐渐放松了警惕。
这时，杨义臣挑选精锐骑兵二千余人，连夜绕道到张金称大营的后面，进行攻击，张金称离营迎战，杨义臣
领兵夹攻，两军展开激战。
此时，杨善会乘张金称领军离营之际，率军攻击其辎重营寨，张金称闻之，引兵救援。在三面攻击之下，张金称大败，带领残兵败将往东逃窜，杨善会领军紧追不舍。一个月后，张金称在馆陶全军覆没，本人被俘。杨善会将其押解到清河郡，立木于市，悬其头，张其手足，令仇家割食之。
张金称的士卒有数千人被捕获，都不予受降，全部被杀，可见双方积怨之深。
漏网的部下，逃进高鸡泊沼泽地，投靠了窦建德。
杨义臣乘胜进军来到平原县，准备攻打高士达等义军在高鸡泊的大本营。
窦建德对高士达说：“杨义臣乃隋之名将，刚刚打败张金称，锐气正盛，不能力敌。我们应该往高鸡泊的沼泽深处撤退，他们地势不熟，足以周旋，拖他几个月后，待敌疲惫，再予反击，可获全胜。”
高士达及大多数将领都认为窦建德的建议太消极，怎能不经战斗就舍弃苦心经营数年的大本营呢！高士达说道：“我领精兵，会会杨义臣，如果敌军势大，再听从贤弟的建议不迟。”
遂留下窦建德守卫大本营，自己率领精兵迎战杨义臣。杨义臣知道高鸡泊内地势复杂，一旦敌人败退到深处，将难以尽数讨灭，故而连输数阵，撤退二十里。
高士达初战得胜，见敌军撤离，就大摆酒宴庆祝。
窦建德得知后对嫡系说：“东海公还没有打败敌人就自高自大，恐怕灾祸不远了。”
于是留下大部分人马守卫军营，自己带领精兵五百前往增员，以防高士达吃败仗。还没赶到高士达的营地，就见到己方溃败的士兵，原来杨义臣果然大败高士达，并战场上斩杀了他，正在乘胜追击。窦建德立刻回兵，赶到大本营时，发现许多守营的士兵已经逃跑了，窦建德只好带领残部逃进了沼泽深处。
杨义臣攻入高士达的大本营后，见高鸡泊深处沼泽密布，道路难辨，只好放弃继续追击，退出了高鸡泊。
杨义臣剿灭了张金称、斩杀了高士达后，率部进军渤海郡，讨伐格谦率领的义军。
格谦的义军在渤海郡一带活动，并没有太多的烧杀抢掠，主要是靠把持食盐买卖和向大户讨要保护费来筹措军费，当地官兵也不敢拼命剿杀，达成了一定的平衡。杨义臣闻此情况，派人与格谦谈判，只要格谦率众投降，朝廷将准许他们解甲归田，既往不咎。格谦面对杨义臣的大军，想到张金称和高士达都已经战败身亡，心中胆怯，率众投降。格谦部将高开道不愿投降，率领数百不愿意投降的士兵隐入豆子岗深处。
格谦义军的营地被焚毁，数万人就地解散回归乡里，格谦及其亲随数百人被迁到渤海以南八百里的东海郡，分给了一块产盐池，继续从事盐业。
一时间，河北、山东的起义大军纷纷被消灭，或隐匿起来。
杨广在朝会上宣布要外出巡游，南下江都（扬州）。
来护儿赶紧劝谏道：“如今天下大乱，不是陛下巡游之时。您应留在洛阳，指挥大军平定战乱。”
杨广恼怒不已，一连数日都不召见来护儿。后来，杨广怒气稍解，招来护儿入见，对他说道：“连你都这样想，我还有什么指望？”
来护儿不敢再言。（注：由上述可见，来护儿是杨广最亲近的臣子，另一个是宇文述。）
杨广认为洛阳与反叛势力最盛的瓦岗军太近，雁门之围已经让杨广吓破了胆，他再也不想经历这样的险境了，最近他一直睡不好觉，睁眼到天亮，个中滋味又能向谁诉说！希望到了江都，能使内心安稳。
杨广令孙子杨侗留守东都洛阳，金紫光禄大夫段达、太府卿元文都、代理民部尚书韦津、右
武卫将军皇甫无逸、右司郎卢楚等人辅佐。
616年（大业十二年）七月，杨广率领满朝文武，摆驾江都。
杨义臣在招抚格谦叛军之后，依然游弋河北一带，随时把战况和河北群贼蜂起的情况上书朝廷。朝中内侍郎虞世基负责把各地上奏的表文呈送杨广，他知道杨广不愿听到各地盗乱情况的奏报，每当有这样的奏报，杨广都大发雷霆，借故拿身边人撒气。后来，虞世基只好尽量报喜不报忧，掩饰真情，只是对杨广说：“盗贼成不了气候，地方的官吏正在全力追剿，很快就会彻底剿除的。”并劝说皇帝不必忧心介意。
当杨广接到杨义臣在河北剿灭十多万盗匪，收降十多万叛军的捷报后，不禁叹息说：“我原来没有听到盗贼发展到如此地步？贼势发展得这样快，杨义臣降贼这么多？”
虞世基趁机媚言：“圣上宽心，河北平定之势定矣，全国盗匪正在减少。”
纳言苏威却不知趣地说：“全国盗匪是否减少我不知道，我只知道能上交税收的郡县还在减少，甚至东都附近的郡县已经多时不能交税了。”
杨广斥责道：“休得唠叨。”
杨广知道国库财帛已近告罄，无法负担大军长期在外的费用，而且，杨义臣所带之兵是三征高句丽时征调的骁果军，在外二年多了，也到必须休整的时候了，随即下令杨义臣搬兵回朝，并遣散士兵。杨义臣回朝后，因军功升任光禄大夫，不久拜授礼部尚书，不久在官任上去世。
格谦在东海郡生活贫苦不堪，再次反叛，还没有逃到豆子岗，被王世充带兵斩杀。
窦建德率众在高鸡泊隐匿数月后，带兵来到了饶阳县，见没有防备，就打了下来，活捉了县令宋正本。窦建德与其它造反义军不同，不抢掠百姓，不杀官吏，能够安抚民众，很多人愿意跟随他，不久又有了三千多人马。
不久，窦建德率军再次返回平原县，收拾跟随高士达战死者的骸骨，都掩埋好，还为高士达举行葬礼，全军穿起白色的丧服。又招集到数千逃散的士卒，军队又振奋起来，窦建德开始自称将军。
其它义军们凡是捉到隋朝的官吏和当地士绅全都杀掉，惟独窦建德捉到他们时，一定以礼相待。窦建德抓到饶阳县令宋正本后，一直当作贵客，赢得其心。宋正本博学、通晓政务，向窦建德进献平定河北之策：“不征徭役不征兵，两年之内不纳粮，个人资产依隋律，官吏士绅享自由。”
窦建德说道：“你说的真好，这就是我的理想，但是如此一来，我兵饷不足，如何抵御外敌。”
宋正本答道：“你们义军每次攻打县城，为何受到顽强抵抗？他们不是为了官府，是保护家园的自发行动。
至少你对家乡这几个县要采取如此政策，他们必视你为主公，何愁没有保护根基的力量呢？”
窦建德醒悟，说道：“先生果然高见！”
从此，宋正本成了窦建德的谋臣。此后，窦建德按照宋正本献策实施，隋朝郡县的长官逐渐地献城投降，军队气势更加兴旺。
617年（大业十三年）正月，窦建德在河间、乐寿两县的交界处设立祭坛举行典礼，自称长乐王，年号就用这年的干支叫丁丑，设置机构委任官吏，实现了由草莽向割据政权的转变。
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注：
后世有人评论，杨广若不去江都，李渊可能不敢造反，派遣十万骁果军也许能平定瓦岗军，大隋就不会这么快就亡了。
其实，无论杨广在哪已无区别，李渊还是会反，若派出十万骁果军，也是是肉包子打狗，一去不回。（此时是秦失其鹿，群雄共逐之，谁有十万大军都会反的。）